Tierra سفارشات آنلاین پروتئین را می پذیرد:


نوشتن DNA و زیست شناسی مصنوعی دست به دست هم می دهند. اکنون Tierra Biosciences می‌خواهد این دست را به سمت پروتئین‌ها دراز کند. برای انجام این کار، آنها اولین پلتفرم سفارش آنلاین پروتئین را راه اندازی کرده اند. مانند سفارش DNA الیگو (یا پیتزا)، یک دانشمند می‌تواند پروتئین‌ها را به صورت آنلاین با افزودن آن‌ها به سبد خرید خود سفارش دهد و سپس منتظر بماند تا به درب منزل برسد.

پلت فرم پروتئین Tierra یک سیستم بدون سلول است که به محققان اجازه می دهد تا پروتئین هایی با حداکثر ۱۰۰۰ اسید آمینه سفارش دهند. Tierra خاطرنشان کرد که این اندازه باید برای اکثر شرایط کافی باشد، زیرا میانگین اندازه پروتئین ۲۰۰-۳۰۰ اسید آمینه است.

Zachary Sun، PhD، یکی از بنیانگذاران و CSO Tierra می گوید: “مرز اصلی بیولوژیکی بعدی بعد از ژنومیکس، پروتئین ها هستند، با توجه به شکل و عملکرد متنوع آنها، از تبدیل دی اکسید کربن به نشاسته تا مبارزه با عفونت ها در بدن ما.” با این حال، کمبود ابزارهای تحقیقاتی مناسب و پلتفرم‌های سفارش برای مهندسان پروتئین وجود دارد، که می‌تواند تنگناهای زمانی و هزینه‌ای قابل توجهی برای تحقیقات حیاتی زیست‌شناسی مصنوعی ایجاد کند.

فناوری که زیربنای این پلتفرم است توسط Sun در طول کار فارغ التحصیلی او در آزمایشگاه ریچارد موری، استاد کنترل و سیستم های دینامیکی و مهندسی زیستی در موسسه فناوری کالیفرنیا و یکی از بنیانگذاران شرکت توسعه یافت. فناوری پایه در مقاله ای با عنوان “DNA خطی برای نمونه سازی سریع مدارهای بیولوژیکی مصنوعی در اشریشیا کلی: مبتنی بر TX-TL Cell-Free System، و در مجله منتشر شده است: زیست شناسی مصنوعی ACS: در سال ۲۰۱۴. این شرکت بلافاصله پس از دریافت مدرک سان در سال ۲۰۱۵ شروع به کار کرد.

سیستم بدون سلول از اتوماسیون و هوش مصنوعی برای فعال کردن سنتز پروتئین که کاملاً خارج از بدن است استفاده می کند. Tierra خاطرنشان کرد که آنها می توانند سه پارامتر را هنگام ساخت پروتئین ها تغییر دهند: ۱) انواع توالی، تولید و بیان انواع مختلف DNA به صورت موازی، ۲) سیستم های بدون سلول، با سیستم هایی که گونه های گرم مثبت، گرم منفی و یوکاریوتی را در بر می گیرند، ۳) تغییرات، با مکمل های کوفاکتورها یا نمک ها.

در حال حاضر، محصول استاندارد Tierra 50 میلی لیتر از هر پروتئین را فراهم می کند. آنها می گویند که غلظت پروتئین بر اساس خواص منحصر به فرد هر پروتئین و راندمان بیان در سیستم می تواند بسیار متفاوت باشد، اما میانگین بازده در محدوده میکروگرم است. هزینه یک پروتئین تقریباً ۶۰۰ دلار است.

در مورد تغییرات پروتئین چطور؟ سیستم بدون سلول: E. coli: مستقر. بنابراین، انتظار می‌رود که پروتئین‌ها در صورت تولید از طریق یک فرآیند شبیه‌سازی معمولی، هر گونه اصلاحاتی داشته باشند: E. coli.

Tierra خود را یک شرکت زیست شناسی مصنوعی می داند و در نظر دارد برای سایر شرکت های زیست شناسی مصنوعی که نیاز به تولید سریع چندین پروتئین مختلف دارند، نقشی ایفا کند.

به عنوان مثال، یک شرکت مستقر در سن دیگو، Debut Biotech، برای تبدیل قندها به مواد شیمیایی نیاز به حل یک سوال مهندسی متابولیک داشت. برای کشف کارآمدترین مسیر متابولیک، که شامل چندین آنزیم است، آنها نیاز به انجام یک جستجوی ترکیبی داشتند. آنها به آنزیم‌ها از Tierra دستور دادند تا چندین ترکیب را آزمایش کنند و سعی کردند آنزیم‌ها را برای هر مرحله از مسیر بهینه کنند.

مثال دیگر از یک شرکت زیست شناسی مصنوعی است که چرم بدون گاو را ابداع کرده است. این شرکت باید صدها شکل مختلف از پروتئین کلاژن را آزمایش می‌کرد و ترکیباتی را برای بهینه‌سازی مواد برای شکل دادن به چرم مورد استفاده در ساخت کفش، در مقابل چرم برای ساخت مچ بند یا کیف دستی آزمایش می‌کرد.

کورینا چن، یکی از شرکای Material Impact که در جولای ۲۰۲۱ به عنوان مدیرعامل به Tierra پیوست، گفت: GEN: که شرکت های زیست شناسی مصنوعی باید وقت خود را صرف نوآوری در محصول کنند تا تولید پروتئین.

گزینه‌های کنونی برای تولید پروتئین، از تولیدکنندگان قراردادی گران قیمت، کیت‌هایی که می‌توانند پپتیدهای رایج را در مقادیر کم سنتز کنند، تا روش‌های قدیمی شبیه‌سازی و خالص‌سازی را شامل می‌شود. Tierra – که دارای اندازه سفارش متوسط ​​۵۴ پروتئین است – امیدوار است گزینه جدیدی برای سنتز پروتئین بدون سلول ایجاد کند.

رژیم آنلاین دکتر روشن ضمیر https://rdiet.ir/ رژیم کتوژنیک دکتر روشن ضمیر